

Ilość: 50 reakcji
Zestaw real-time PCR do jakościowego wykrywania metylacji genów NDRG4/SEPT9/SFRP2/BMP3/SDC2 w złuszczonych komórkach jelitowych z próbek ludzkiego kału.
(edit with the Customer Reassurance module)
(edit with the Customer Reassurance module)
(edit with the Customer Reassurance module)
Epidemiologia:
U osób dorosłych codziennie ponad 10^8 komórek nabłonka jelitowego jest wydalanych z kałem. Ze względu na to, że komórki nowotworowe są bardziej podatne na złuszczanie w wyniku nieprawidłowej proliferacji, kał pacjentów z nowotworem jelita zawiera wiele chorych komórek i nieprawidłowych składników komórkowych. Badania wykazały, że modyfikacja metylacji promotorów genów jest wczesnym etapem powstawania nowotworów, a materiał genetyczny uzyskany z próbek kału pacjentów z rakiem jelita grubego pozwala na wczesne wykrycie obecności raka w jelicie. NDRG4, znany również jako SMAP-8 i BDM1, jest jednym z czterech członków rodziny genów NDRG (NDRG1-4), który, jak wykazano, jest powiązany z proliferacją, różnicowaniem, rozwojem i stresem komórek. Potwierdzono, że metylacja NDRG4 jest potencjalnym biomarkerem raka jelita grubego w próbkach kału. SEPT9 należy do rodziny genów Septin, która składa się z co najmniej 13 genów kodujących konserwatywną domenę GTPazy, która może wiązać białka związane z cytoszkieletem i jest powiązana z podziałem komórkowym i powstawaniem nowotworów. Badania wykazały, że zawartość metylowanego genu Septin9 jest charakterystycznie zwiększona w próbkach kału od pacjentów chorych na raka jelita grubego. sFRP stanowią klasę antagonistów szlaku Wnt ze względu na ich wysoką homologię strukturalną z receptorem "frizzled" (Fz) dla sygnalizacji Wnt. Inaktywacja genu SFRP powoduje niekontrolowaną aktywację sygnalizacji Wnt związaną z rakiem jelita grubego. Obecnie metylacja SFRP2 w kale może być stosowana jako nieinwazyjny biomarker w diagnostyce raka jelita grubego. BMP3 należy do nadrodziny TGF-B i dlatego odgrywa ważną rolę w rozwoju embrionalnym poprzez indukcję i kształtowanie wczesnego tworzenia kości. BMP3 ulega hipermetylacji w przypadku raka jelita grubego i może być stosowany jako ważny marker nowotworowy. SDC2 to proteoglikan siarczanu heparanu znajdujący się na powierzchni komórki, biorący udział w regulacji wielu procesów fizjologicznych i patologicznych. Przetwarzanie fizyczne obejmuje proliferację komórek, różnicowanie, adhezję, organizację cytoszkieletu, migrację, gojenie się ran, komunikację komórka-macierz, angiogenezę. Procesy patologiczne obejmują stany zapalne i raka. Poziom metylacji genu SDC2 w tkankach raka jelita grubego jest znacząco wyższy niż w tkankach prawidłowych.
Kanał:
Bufor reakcyjny A |
VIC/HEX |
metylowany gen NDRG4 |
ROX |
metylowany gen SEPT9 |
|
CY5 |
kontrola wewnętrzna |
|
Bufor reakcyjny B |
VIC/HEX |
metylowany gen SFRP2 |
ROX |
metylowany gen BMP3 |
|
FAM |
metylowany gen SDC2 |
|
CY5 |
kontrola wewnętrzna |
Interpretacja wyniku:
Gen |
Kanał sygnałowy |
Wartość Ct |
Interpretacja |
NDRG4 |
VIC (szesnastkowy) |
Wartość Ct≤38 |
NDRG4 dodatni |
Wartość Ct>38 |
NDRG4 ujemny |
||
SEPT9 |
ROX |
Wartość Ct≤38 |
SEPT9 dodatni |
Wartość Ct>38 |
SEPT9 negatywny |
||
SFRP2 |
VIC (szesnastkowy) |
Wartość Ct≤38 |
SFRP2 dodatni |
Wartość Ct>38 |
SFRP2 ujemny |
Parametry techniczne:
Składowanie |
Ciecz: ≤-18 ℃ |
Okres przydatności do użycia |
9 miesięcy |
Typ próbki |
Próbka kału |
CV |
≤5,0% |
Specyficzność |
Nie ma reakcji krzyżowych z rakiem wątroby, rakiem dróg żółciowych, rakiem tarczycy i rakiem płuc |
Kompatybilne systemy |
QuantStudio®5 SLAN-96P LightCycler®480 LineGene 9600 Plus MA-6000 |